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文献解读G影学堂FGB
  • Nucleic Acids Research丨华中农业大学动物遗传育种团队发布基因组育种大数据计算新工具HIBLUP(天权)

    该研究系统分析了已有遗传评估算法特点,针对现有算法在处理快速增长的基因组育种大数据时面临的瓶颈问题,首创基于V矩阵的“HE+PCG”策略,可完全避免遗传评估计算过程中的大矩阵求逆,开发出更适合基因组育种大数据时代的高性能计算新工具HIBLUP。

    2023年02月22日
  • Communications Biology丨中国农业大学李孟华团队在绵羊环境适应性方面取得新进展

    该研究揭示了脂尾羊相较于瘦尾羊在应对恶劣环境方面的代谢优势及其内在的遗传、生理机制。在全球气候变化的大趋势下,该研究成果为我国地方家畜品种遗传种质优势的发掘工作提供了新思路,有利于加快我国家畜创新育种进程。

    2023年02月14日
  • Mol. Biol. Evol |佛科院刘庆友教授等团队合作揭示穿山甲蚁食习性和鳞片生成适应性进化全新分子机制

    该研究构建了马来穿山甲和中华穿山甲染色体级别基因组,对穿山甲22个不同组织进行了的转录组测序分析,并对穿山甲背部长鳞片组织和腹部无鳞片组织进行了比较转录组、蛋白质组分析。解析了珍惜保护动物穿山甲重要性状形成的调控机制,对于穿山甲进化和独特功能形成的分子机制具有重要意义,同时对于穿山甲保护也具有一定的价值。

    2023年01月07日
  • Mol. Biol. Evol | 浙江大学周琦教授等团队合作揭示父爱模范动物海马的性染色体演化机制

    该研究在实验室前期报道的膨腹海马基因组相关研究的基础上,首次鉴定了两种我国常见海马物种,膨腹海马和线纹海马的性染色体和性别决定区域,通过比较分析揭示了海马育儿囊相关基因的适应性演化,以及动物不同性染色体系统相互颠换的演化机制。

    2022年12月30日
  • Briefings in Bioinformatics | 华中农大动物遗传育种团队发布猪基因组精准选配技术体系

    该研究创建了完整的基因组精准选配技术体系,公开了基因组精准选配原理、算法、软件和操作流程,并首次利用基因组精准选配技术开展杜长大三元商品猪高效生产技术研究。

    2022年12月28日
  • 文献解读|中科院基因组研究所张治华团队研发了稀疏ATAC-seq数据准确预测核小体占位算法和工具

    中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)张治华课题组开发了一种基于ATAC-seq数据高灵敏度和高精度的核小体占位预测算法,命名为deNOPA。deNOPA在分析单细胞ATAC-seq数据时,也能准确预测核小体占位;因此,未来在单细胞水平上利用超稀疏数据研究核小体排列的变化成为可能。

    2022年12月13日
  • Nat. Commun | 中科院南海所林强等团队揭示海马基因点突变导致“脾脏丢失”与“雄性怀孕”的协同进化机制

    2022年12月10日
  • Sci Adv | 上海交大卞迁/代杰文团队合作揭示颅颌面软骨发育过程中增强子的动态调控规律

    该研究以关键转录因子Sox9位点为模型探究了发育过程中增强子使用的偏好性,发现染色质拓扑结构的差异可以导致活性相似的Sox9远端增强子在神经嵴来源的下颌软骨和中胚层来源的四肢软骨中行使不同的调控功能,这一发现是对现有增强子调控理论的重要补充,并为理解颅颌面发育缺陷的遗传学机制提供了线索。

    2022年11月29日
  • NAR|华中农大左波团队揭示lncMREF与Smarca5/p300复合体互作促进成肌分化和肌肉再生的新机制

    该研究揭示了一种肌肉再生过程中lncRNA介导的时空特异性调控机制,为深入解析肌肉生长发育调控网络提供了新的理论依据。

    2022年11月28日
  • MBE | 西北农林科技大学王小龙等团队揭示野羊向家山羊的基因渗入帮助其快速适应高原环境

    该研究报告了西藏山羊基因组中的一个新的受选择基因PAPSS2,并通过进一步分析发现,该基因源于山羊在高原地区的一种近缘物种的基因渗入,这一远古时期的基因渗入事件帮助山羊在早期快速适应了高原严酷的自然环境。

    2022年11月19日
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