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文献解读G影学堂FGB
  • 多组学揭示水稻氮吸收与分蘖形成的分子机制

    研究团队揭示了水稻中一个名为OsGATA8的转录因子如何作为关键调控因子,同时调控氮素吸收和有效分蘖的形成,这对于培育高产氮素利用率(NUE)的水稻品种具有重要意义。

    2024年09月06日
  • 多组学技术解析耐寒猪应对冷刺激的表观遗传调控机制

    该研究以中国两个耐寒猪品种—民猪(Min)和恩施黑猪(ES)为材料,采用H3K27ac CUT&Tag、RNA-seq和选择信号分析的多组学整合策略,解析了东北民猪和恩施黑猪间脑组织与脂肪组织冷刺激处理后的表观基因组特征变化。

    2024年07月20日
  • NC案例 | 猪等位基因差异表达调控研究新进展

    研究发现不同组织和发育阶段的基因表现出不同表达模式,这不仅突出了基因调控的动态变化,而且为发育过程中基因表达的细微控制提供了有价值的见解。还发现组织特异性基因的数量明显高于发育阶段特异性基因,这表明组织特异性表达模式在发育早期已完成并持续存在。

    2024年07月19日
  • DNA甲基化分析案例解析 | 牦牛脂肪细胞分化过程中的DNA甲基化动态研究

    研究结果表明DNA甲基化及其与染色质可及性的互作调控着牦牛脂肪细胞分化过程中的基因表达,有助于了解脂肪形成过程中各种表观遗传修饰及其互作机制。

    2024年07月05日
  • 多组学联用探究单胎和多胎藏羊繁殖性能差异遗传调控机制

    这项研究为藏羊繁殖力的提高和畜牧业的可持续发展提供了宝贵的遗传资源,也为未来各种气候变化情景下的育种计划提供了指导。

    2024年07月01日
  • Cell案例解读 | 人类基因组串联重复多态性在疾病研究中的价值

    该研究结合了长读长单倍型基因组组装数据和公共数据库的基因组和表型数据,通过创新VNTR基因分型方法,联用关联分析和精细定位筛选到58个影响复杂性状的VNTRs,其中18个还会调控附近基因的表达或剪接。

    2024年06月14日
  • 项目案例 | 雷初朝教授团队首次揭示黄牛适应青藏高原的多基因协同效应

    该研究通过对海拔3400一4300米的8个青藏高原黄牛群体的父系、母系和核基因组水平进行系统评估,发现青藏高原黄牛群体内部遗传多样性非常高,至少可分为5个高度分化的群体,表明青藏高原拥有丰富的地方黄牛遗传资源,具有极大的挖掘潜力。

    2024年05月29日
  • 多组学联合解析膳食性肥胖的下丘脑表观遗传景观

    研究表明高脂饲料喂养会导致下丘脑整个基因组的组蛋白修饰、DNA甲基化和染色质可及性失调。与长期喂养高脂饲料相比,短期喂养更明显地扰乱了表观遗传景观,并且以细胞类型特异性的方式对染色质可及性造成了失调。本研究强调了高脂饲料喂养对下丘脑表观遗传景观的深远影响,这种改变与肥胖症及其相关并发症的病理生理学的相关性仍有待确定。

    2024年05月20日
  • 基因组所李奎团队发布最全面的猪基因组结构变异图谱

    该研究基于全球1060头猪(Sus scrofa)的全基因组重测序数据,涵盖了101种不同品种,旨在深入了解猪的结构变异(SVs)对复杂表型的影响。研究人员利用全基因组序列数据,构建了一份全面的结构变异图谱,占猪基因组的9.6%,鉴定了42,487个缺失,37,913个移动元素插入,3308个复制,1664个倒置以及45,184个断裂端,本研究呈现出了猪基因组的多样性。

    2024年05月13日
  • Nature Communications | 绵羊全身组织多组学研究揭示高原缺氧环境短期适应性的可遗传机制

    该研究以绵羊作为动物模型进行“低海拔-高海拔”转移试验,利用高通量测序技术构建了高原转移前和转移后适应过程中的4个时间点(7天、14天、21天和8个月)的19种组织的转录组(RNA-Seq, scRNA-Seq)和表观组学(ATAC-Seq)图谱;同时通过整合全基因组重测序(WGS)、染色质构象捕获(Hi-C)和20种测量表型数据揭示了母代和子代短期高原适应的动态转录调控机制。

    2024年05月11日
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