该数据库包含来自猪、牛、羊和鸡基因组的19个组织和12个细胞系的538个表观基因组数据集,共计有65124531个潜在功能突变位点。IFmut数据库有一个用户友好的web界面,允许用户查询感兴趣的突变位点或不同的基因组区域,以及可视化表观基因组信号分布情况。
2024年03月21日
过去20年,随着技术的进步,国内外研究人员对表观遗传调控分子机制的解析取得了显著进展,这对更好地理解组织器官发育以及生物表型形成的分子细胞基础产生了深远影响。本文重点介绍了表观多组学的研究技术在猪功能基因组研究中取得的成果案例。
2024年02月23日
该团队研发的具有自主知识产权的基因组选择信号检测和分类新工具DASDC,为动物群体遗传解析及经济性状改良研究提供了新的方法和工具,也为我国生物多样性研究提供了重要的技术支撑。
2024年02月09日
AGIDB整合了89个物种共17,360个样本全基因组测序数据和11个物种的SNP芯片数据,数据量累计达688.57 TB。
2023年11月01日
华中农业大学猪遗传育种赵书红教授团队研发出了一系列新的基因编辑底盘工具酶,开发了具有我国自主知识产权的精准CRISPR基因编辑技术,有望打破基因编辑底层专利垄断。
2023年07月31日
该研究通过整合全基因组关联分析与三维基因组信息,成功鉴定到影响猪重要经济性状的关键基因及其调控元件上的功能突变,解析了该突变如何通过影响增强子调控猪眼肌深度性状的分子机制。
2023年07月18日
该研究系统分析了已有遗传评估算法特点,针对现有算法在处理快速增长的基因组育种大数据时面临的瓶颈问题,首创基于V矩阵的“HE+PCG”策略,可完全避免遗传评估计算过程中的大矩阵求逆,开发出更适合基因组育种大数据时代的高性能计算新工具HIBLUP。
2023年02月22日
该研究揭示了脂尾羊相较于瘦尾羊在应对恶劣环境方面的代谢优势及其内在的遗传、生理机制。在全球气候变化的大趋势下,该研究成果为我国地方家畜品种遗传种质优势的发掘工作提供了新思路,有利于加快我国家畜创新育种进程。
2023年02月14日
该研究构建了马来穿山甲和中华穿山甲染色体级别基因组,对穿山甲22个不同组织进行了的转录组测序分析,并对穿山甲背部长鳞片组织和腹部无鳞片组织进行了比较转录组、蛋白质组分析。解析了珍惜保护动物穿山甲重要性状形成的调控机制,对于穿山甲进化和独特功能形成的分子机制具有重要意义,同时对于穿山甲保护也具有一定的价值。
2023年01月07日
该研究在实验室前期报道的膨腹海马基因组相关研究的基础上,首次鉴定了两种我国常见海马物种,膨腹海马和线纹海马的性染色体和性别决定区域,通过比较分析揭示了海马育儿囊相关基因的适应性演化,以及动物不同性染色体系统相互颠换的演化机制。
2022年12月30日