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文献解读G影学堂FGB
  • 文献解读 | STAG2在黑色素瘤中通过染色质三维空间构象重塑调控干扰素信号

    2022年4月6日,美国哈佛大学皮肤生物研究中心(Cutaneous Biology ResearchCenter)郑斌教授团队在Nature Communications上发表题为“STAG2 regulates interferon signaling in melanoma via enhancer loop reprogramming"的研究论文,该文通过表观多组学整合分析揭示了 STAG2在黑色素瘤中的3D基因组调控模式。

    2022年04月18日
  • 单细胞m6A测序,仿佛看到新流量密码!

    近年来,RNA修饰介导的基因表达调控是目前表观遗传研究领域的热点之一,而m6A RNA修饰又是其中最为主流的研究方向。杜克大学Kate Meyer课题组最近在Molecular Cell上发表了关于单细胞m6A测序的文章《scDART-seq reveals distinct m6A signatures and mRNA methylation heterogeneity in single cells 》

    2022年04月12日
  • 华中农业大学赵书红、李新云领导的动物遗传育种团队在猪调控元件鉴定方面取得新进展

    赵书红教授与李新云教授团队绘制了目前涵盖品种信息和组织类型最广的猪基因组启动子、增强子、开放染色质区域及三维基因组精细图谱,大规模鉴定了顺式调控元件及调控区突变位点,揭示了影响猪表型变异的潜在调控机理,为应用功能SNP位点提升猪基因组育种效率奠定了基础。

    2022年03月29日
  • 细胞特异性三维表观基因组解读大脑发育基因调控机制

    本文发表在Nature上的“Cell type-specific 3D epigenomes in the developing human cortex”,该文章综合利用多组学联合解析GWAS、eQTL或选择清扫(selective sweep)发掘得到的关键遗传变异,是不可多得的分析模板,具有不错的参考价值。

    2022年03月28日
  • 猪miRNA顺式调控元件的表观基因组学分析

    该文分析并整合了已发表大白猪肌肉和脂肪组织的表观多组学数据,识别了miRNA的功能顺式调控元件,为理解猪肌肉和脂肪中miRNA调节的分子机制提供了理论依据。影子基因为本项目表观多组学分析工作提供了资源支持。

    2022年03月24日
  • 一文读懂遗传育种研究利器“功能位点基因芯片”

    影子基因为遗传育种专家功能位点基因芯片设计(包括数据积累)、制备、检测及育种应用提供整体解决方案

    2022年03月24日
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