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  • 牛高海拔适应性进化遗传基础研究

    本研究通过群体遗传学与多组学整合,系统解析了藏牛高海拔适应的分子机制。发现近期选择与耗牛基因渗入共同驱动体型、代谢和低氧响应的协同演化,为理解哺乳动物环境适应提供新视角。

    2025年04月01日
  • PIGOME : 猪功能基因组研究与分子育种的“一站式”分析平台

    该研究提供了猪整合多组学数据库PIGOME(https://pigome.com),为猪功能基因组研究与分子育种提供了“一站式”分析平台。

    2025年03月18日
  • Adv Sci|绘制鸡骨骼肌生长发育过程中的单倍型三维基因组图谱

    该研究通过肉鸡和蛋鸡的正反交家系,结合高深度in situ Hi-C、全基因组测序和转录组数据,绘制了杂交鸡骨骼肌的高分辨率单倍型三维基因组动态图谱,揭示了同源染色体的空间结构特征,并在多个尺度上系统地解析了骨骼肌染色质空间构象在多个发育阶段的动态变化。

    2025年03月04日
  • Advanced Science|刘毓文/赵云翔课题组开发基因型填充框架实现囊胚单细胞SNP分型

    该研究开发了一种全新的基因型填充计算框架DPImpute,为小样本量超低覆盖度全基因组测序(ulcWGS)提供了高效、精准的解决方案,显著降低了基因组选择的成本,提高了应用场景的灵活性,并首次实现了动物囊胚(杜洛克猪)单细胞全基因组SNP基因型准确分型,为胚胎基因组选择提供了重要的技术支撑。

    2025年02月28日
  • EXPERT:一种新型先导基因编辑工具,可实现100bp以上片段精准高效编辑

    这种创新工具通过在pegRNA nick所在DNA链上游引入额外切口、优化改造pegRNA末端结合区以及引入突变抑制游离片段对新链合成的干扰,实现了100bp以上片段的高效精准编辑。

    2025年02月13日
  • Nature Genetics | 中国农业大学李孟华教授团队发表首个绵羊T2T参考基因组

    该研究首次完成了中国著名的高繁殖力品种湖羊(HU3095)的端粒到端粒无间隙基因组组装(T2T-sheep1.0),其中包括完整的Y染色体(T2T-sheep1.0-chrY)和着丝粒区域的组装。

    2025年01月10日
  • NC | 华中农业大学棉花团队解析棉花全生育期亚基因组表达不对称的表观遗传调控机制助力基因组育种

    该研究开启了棉花DNA元素百科全书(ENCODE)计划,揭示了亚基因组三维空间结构和表观修饰状态在全生育期中的动态重塑特征,解析了亚基因组表达不对称的表观调控机制,探究了非编码功能元件在纤维品质改良过程中的遗传调控效应及其育种价值。

    2024年12月30日
  • Genome Research | 刘毓文课题组开发增强子调控网络构建框架解析猪产肉性状遗传基础

    该研究创新性地提出一套分析框架,通过整合超级增强子(Super-enhancer,SE)发育时序模式、eRNA活性、基因表达、GWAS信号以及基于STARR-Seq的增强子调控型SNPs等多方面信息,精准识别影响性状的候选关键增强子。利用该分析框架,研究团队鉴定出了影响生猪产肉相关性状的候选关键增强子及其靶基因。

    2024年12月24日
  • iMeta|中国农科院基因组所唐中林团队揭示东西方猪种表型差异的遗传机制

    该研究通过整合不同猪品种的基因组、转录组和甲基化组数据,揭示了中外品种猪骨骼肌生长发育和产肉性状差异等形成的表观调控机制,解析了猪复杂性状形成和表型分化的遗传基础。

    2024年12月22日
  • 项目案例|兰州大学团队绘制出国际首张绵羊多组织表观遗传调控图谱

    该研究基于绵羊9个重要组织的多维度(RNA-Seq、ATAC-Seq、CUT&Tag和Hi-C)数据,绘制出国际首张绵羊多组织表观遗传调控图谱,对绵羊基因组进行了系统功能注释,鉴定出753,723个非冗余功能元件,其中60%以上为首次发现,主要包括与感知能力、免疫反应和尾部脂肪沉积相关的组织特异性启动子和增强子;

    2024年12月18日
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