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文献解读G影学堂FGB
  • 华中农业大学申邦教授团队解析了染色质重塑复合物SNF2L对弓形虫分化发育的调控作用与机制

    该研究揭示了一个全新的染色质重塑复合物在弓形虫分化发育中的关键作用,为理解弓形虫在不同发育阶段的生命活动调控提供了新视角,也为设计阻断弓形虫传播的疫苗与药物提供了新思路。

    2025年07月05日
  • 华南农业大学动物科学学院吴珍芳教授团队揭示猪肌纤维类型分化及转化机制

    该研究首次揭示了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异,通过整合表观基因组学与三维基因组学分析并结合分子实验,阐明了超级增强子调控肌纤维类型分化与转化的分子机制。

    2025年07月04日
  • FarmGTEx系列之PigGTEx:养猪业革命性突破!发布全球最大规模“猪基因调控图谱”

    迄今为止最全面的猪多组织基因调控图谱!这项研究如同绘制了一幅“猪生命活动的地图”,不仅将加速优质猪种的培育,更揭示了猪作为人类生物医学模型的巨大潜力。让我们一起来解读这份“基因天书”!

    2025年06月26日
  • FarmGTEx系列之CattleGTEx:全球首个“牛基因开关地图”,揭秘奶牛高产、抗病的核心密码

    该研究整合了超过7000份样本,绘制了全球首个涵盖多组织的牛多组织调控变异图谱(CattleGTEx),这一研究成果为深入理解奶牛重要经济性状的分子机制,以及推动精准育种实践提供了坚实的数据基础与研究框架!

    2025年06月20日
  • 突破性研究:CUT&Tag技术成功恢复半数ENCODE组蛋白修饰信号

    该研究首次系统评估了CUT&Tag在组蛋白修饰H3K27ac和H3K27me3上的性能,揭示了其与ENCODE ChIP-seq数据之间的相关性与差异。研究以K562细胞为模型,从抗体筛选到数据分析提供了全流程的优化策略,明确指出CUT&Tag与ENCODE ChIP-seq数据的一致性与差异,为推进表观遗传研究提供了可操作性的技术参考。

    2025年06月03日
  • 全球鸡基因组参考面板GCRP发布:开启家禽育种新纪元

    研究通过低覆盖度测序与深度测序结合,共鉴定了3,247万个新变异位点,将鸡dbSNP数据库扩展139%。实验证明,GCRP在基因型填充准确率(最高达99.4%)和全基因组关联分析(GWAS)分辨率上均优于现有工具,为家禽遗传改良和进化研究提供了全新平台。

    2025年05月28日
  • Cell Genomics丨张涌/任刚/赵书红团队合作揭示“超级 Pol II 域”调控晚 ZGA 物种基因组激活的新机制

    该研究绘制了包含Pol II、ATAC、Hi-C、Total-RNA在内的九个维度的牛、猪配子和着床前胚胎的表观和转录图谱。

    2025年05月07日
  • ATAC-seq数据:除染色质可及性分析之外,还可应用于基因型及caQTL研究

    研究创新性地展示了如何从未预先进行基因分型的公共ATAC-seq数据中联合推断基因型、调用开放染色质峰并鉴定caQTL。

    2025年05月06日
  • 猪表型组研究新进展:使用普通摄像头实时准确测定猪只体重

    该研究团队首次提出了基于猪只轮廓信息(而非分割图像)进行体重测定的新策略,并创新性地构建了双神经网络框架(CIEN-LWEN)。CIEN-LWEN框架能够利用普通2D摄像头,精确提取处于自然活动状态下的猪只图像高精度轮廓信息,并直接利用基于所提取的轮廓数据实现了对猪只体重的高效精确预测,相比于传统方法,该框架显著降低了硬件成本和计算时间,具备良好的大规模部署应用前景。

    2025年04月28日
  • Adv Sci|吴珍芳团队揭示中西方猪种的双向基因渗入及其影响

    该研究通过整合现代与古代家猪DNA数据,发现我国华南猪对欧洲商业品种的基因贡献率达16.6%,共鉴定到3558个潜在基因组渗入片段和30个渗入SVs,并发现调控体型大小的BMP2基因座具有明显的渗入信号。借助古基因组数据发现,BMP2渗入单倍型可能源于古代欧洲种群。

    2025年04月18日
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